Posgrado en Bioacústica

¿Te gustaría estudiar una maestría o doctorado en vocalizaciones de mamíferos marinos, aves, ranas o murciélagos? 

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El Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional Unidad Oaxaca (CIIDIR) ofrece posgrado en maestría y doctorado en Ciencias en Conservación y Aprovechamiento de Recursos Naturales. El posgrado está conformado por 4 academias de investigación. Mi laboratorio se encuentra dentro de la academia de Patrones y Procesos para la Biodiversidad del Neotrópico en donde nos enfocamos al estudio de conducta animal, ecología, biología de la conservación, entre otros. El posgrado del CIIDIR se encuentra en el Padrón Nacional de Posgrados de Calidad del CONACYT, por lo que si eres aceptado puedes competir por una beca CONACYT, sin importar si eres mexicano o extranjero.

En el CIIDIR tenemos dos convocatorias por año: Enero-Junio y Julio-Diciembre. Para mayores informes sobre perfil de ingreso y detalles del programa de estudios consulta los siguientes enlaces:

MAESRTRÍA

DOCTORADO

  • La convocatoria vigente la encontrarás aquí (información para mexicanos y extranjeros)

 

El programa de estudios de ambos programas (maestría y doctorado) están orientados a investigación. Uno de los objetivos del programa es que los estudiantes desarrollen un proyecto de investigación, el cual tienen que completar y defender al finalizar sus estudios para poder obtener el grado académico.

Los temas que se investigan en mi laboratorio se centran en la ecología del comportamiento, comunicación animal, evolución de señales acústicas y biodiversidad. La investigación que realizamos se centra en cuatro líneas:

  1. El estudio de factores ecológicos, estocásticos, y genéticos en la estructura de las señales acústicas.
  2. El estudio de interacciones interespecíficas y el uso de señales acústicas para mediar dichas interacciones.
  3. El estudio de los efectos antropogénicos (i.e. ruido urbano) en el comportamiento de poblaciones silvestres de animales.
  4. El estudio y uso de herramientas acústicas (i.e. equipos autónomos de grabación) en el monitoreo de ecosistemas silvestres de animales.

Si bien estos son los temas en los que estamos interesado, también estamos abiertos a escuchar propuestas que involucren otras líneas de investigación. Los trabajos de investigación se basan en aves, y recientemente estoy explorando otros sistemas de comunicación en primates (en colaboración con el Dr. Gabriel Ramos, UNAM), mamíferos marinos (en colaboración con el Dr. Gustavo Hinojosa del CIIDIR Unidad Oaxaca), ranas (en colaboración con la Dra. Edna González) y murciélagos (en colaboración con el Dr.Miguel Ángel Briones Salas), aunque también es posible discutir otros organismos a estudiar.

*Estudiantes mexicanos y extranjeros (especialmente gente de algún país en Centroamérica) son bienvenidos. Durante la maestría y el doctorado aprenderán técnicas avanzadas en análisis de sonidos, diseño de experimentos conductuales, y el manejo de tecnología novedosa como los equipos digitales autónomos de grabación (SM3 de WildLife Acoustics).

Podrás encontrar información detallada sobre el programa de posgrado en el CIIDIR Unidad Oaxaca y proceso de admisión en este enlace.

Si estas interesad@ escribe al correo a jrobertososa@gmail.com, indicando la universidad en la que cursaste tus estudios de licenciatura y maestría (en el caso de los interesad@s en un doctorado), tu promedio final, el proyecto en el que estás interesa@ y adjunta tu CV.

*Cualquier otro proyecto será considerado, siempre y cuando el eje central sea comunicación animal, sin importar el grupo de animales (preferentemente aves; proyectos con murciélagos y ranas también serán tomados en cuenta).

Puedes encontrar información detallada sobre mis trabajos y áreas de interés en los siguientes enlaces:

https://sosalab.wordpress.com

www.ciidiroaxaca.ipn.mx/jrsosa

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¡Bienvenida Margarita!

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El Laboratorio de Bioacústica y Ecología del Comportamiento le da la bienvenida a la Dra. Margarita Briseño Jaramillo como Investigadora Postdoctoral CONACYT. Margarita ha estudiado la comunicación acústica en varios grupos de animales como aves, mamíferos marinos y primates. Los estudios postdoctorales de Margarita se enfocan en el análisis de la influencia social en la comunicación acústica del mono araña en Punta Laguna, Yucatán.

!Bienvenida Margarita!

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Posgrado en el CIIDIR

Estudia el posgrado en el CIIDIR

El Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional Unidad Oaxaca (CIIDIR) ofrece posgrado en maestría y doctorado en Ciencias en Conservación y Aprovechamiento de Recursos Naturales. El posgrado está conformado por 4 academias de investigación. Mi laboratorio se encuentra dentro de la academia de Patrones y Procesos para la Biodiversidad del Neotrópico en donde nos enfocamos al estudio de conducta animal, ecología, biología de la conservación, entre otros. El posgrado del CIIDIR se encuentra en el Padrón Nacional de Posgrados de Calidad del CONACYT, por lo que si eres aceptado puedes competir por una beca CONACYT, sin importar si eres mexicano o extranjero.

En el CIIDIR tenemos dos convocatorias por año: Enero-Junio y Julio-Diciembre.  Actualmente el laboratorio tiene espacio para un alumno de maestría y un alumno de doctorado para la convocatoria de Agosto-Diciembre de 2019. Para mayores informes sobre perfil de ingreso y detalles del programa de estudios consulta los siguientes enlaces:

MAESTRÍA

DOCTORADO

 

MAESTRÍA y DOCTORADO

El programa de estudios de ambos programas (maestría y doctorado) están orientados a investigación. Uno de los objetivos del programa es que los estudiantes desarrollen un proyecto de investigación, el cual tienen que completar y defender al finalizar sus estudios para poder obtener el grado académico.

Los temas que se investigan en mi laboratorio se centran en la ecología del comportamiento, comunicación animal, evolución de señales acústicas y biodiversidad. Mi investigación se centra en cuatro líneas:

  1. El estudio de factores ecológicos, estocásticos, y genéticos en la estructura de las señales acústicas.
  2. El estudio de interacciones interespecíficas y el uso de señales acústicas para mediar dichas interacciones.
  3. El estudio de los efectos antropogénicos (i.e. ruido urbano) en el comportamiento de poblaciones silvestres de animales.
  4. El estudio y uso de herramientas acústicas (i.e. equipos autónomos de grabación) en el monitoreo de ecosistemas silvestres de animales.

Si bien estos son los temas en los que estoy interesado, también estoy abierto a escuchar propuestas que involucren otras líneas de investigación. Mis trabajos de investigación se basan en aves, y recientemente estoy explorando otros sistemas de comunicación en primates (en colaboración con el Dr. Gabriel Ramos), mamíferos marinos (en colaboración con el Dr. Gustavo Hinojosa del CIIDIR Unidad Oaxaca) y murciélagos (en colaboración con el Dr.Miguel Ángel Briones Salas), aunque también es posible discutir otros organismos a estudiar.

Puedes encontrar información detallada sobre mis trabajos y áreas de interés en los siguientes enlaces:

https://sosalab.wordpress.com

www.ciidiroaxaca.ipn.mx/jrsosa

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Doctorado con proyectos enfocados en Bioacústica

Estoy buscando estudiantes de  MAESTRÍA y DOCTORADO que quieran realizar estudios en conducta y comunicación animal en aves, ranas, mamiferos marinos, o murciélagos.

Estudiantes mexicanos y extranjeros (especialmente gente de algún país en Centroamérica) son bienvenidos. Durante la maestría y el doctorado aprenderán técnicas avanzadas en análisis de sonidos, diseño de experimentos conductuales, y el manejo de tecnología novedosa como los equipos digitales autónomos de grabación (SM3 de WildLife Acoustics).

Podrás encontrar información detallada sobre el programa de posgrado en el CIIDIR Unidad Oaxaca y proceso de admisión en este enlace.

Si estas interesad@ escribe al correo a jrobertososa@gmail.com, indicando la universidad en la que cursaste tus estudios de licenciatura y/o maestría, tu promedio final, el proyecto en el que estás interesa@ y adjunta tu CV.

*Cualquier otro proyecto será considerado, siempre y cuando el eje central sea comunicación animal, sin importar el grupo de animales (preferentemente aves; proyectos con murciélagos y ranas también serán tomados en cuenta).

Curso de Bioacústica

Bioacústica: principios, técnicas y aplicaciones para la conservación

En esta sección encontrarán las presentaciones ofrecidas durante el curso en versión PDF, así como actividades y materiales relacionados con el curso. (Para descargar la información deseada haz click en los enlaces resaltados en color).

 

Programa del curso

(Aquí podrás descargar el programa detallado del curso)

I Datos del programa y la asignatura

Tipo de asignatura: Optativa

Número de horas: 60 (Teoría: 48 horas; Practica: 12 horas)

Fecha de la elaboración del programa de la asignatura: Abril 17, 2015

II Profesores

  1. Coordinador de asignatura: Dr. José Roberto Sosa López
  2. Profesor Participante: Dr. Rodolfo Martínez y Cárdenas
  3. Profesor Participante: M. en C. Fernando González García 

III Objetivo

En este curso, los estudiantes aprenderán sobre las propiedades físicas de transmisión y propagación del sonido; la forma en que las señales acústicas son producidas y percibidas por diferentes taxones; la manera en que las señales acústicas se transmiten en diferentes ambientes; el uso de señales acústicas en la comunicación animal y en los comportamientos asociados dicha comunicación; la evolución de las señales acústicas; el uso de la comunicación acústica en organismos sociales; los efectos de los procesos antropogénicos en la conducta vocal de las especies; y el uso de herramientas bioacústicas para la conservación de especies y ecosistemas.

IV Contenido

Tema

 Hrs Bibliografía
1 Introducción: comunicación animal 8
1.1 Breve introducción al estudio de la comunicación animala)   Técnicas y desarrollo de tecnología para el análisis de sonidosb)   Breve introducción a la historia del estudio de vocalizaciones y conductac)    Desarrollo del comportamiento: genes vs. medio ambiente Marler (2004)
1.2 ¿Por qué estudiar comunicación animal?a)   Objetivos en el campo de la comunicación animal Bradbury y Vehrencamp (2011)
1.3 Pistas, señales y su evolucióna)   Pistasb)   Señalesc)    Evolución de las señales Bradbury y Vehrencamp (2011)
1.4 Principios de la comunicación animala)   Limitaciones físicasb)   Mecanismos fisiológicosc)    Historia evolutivad)   Economía de la comunicacióne)   Conflictos de interésf)    Red de comunicaciones Bradbury y Vehrencamp (2011)
1.5 Principios de la biología evolutivaa)   Heredabilidad genéticab)   Selección sexual y naturalc)    Afinidad filogenética Bradbury y Vehrencamp (2011)
1.6 Clasificación de sistemas de comunicación animala)   Clasificación por preadaptación, modalidad y mediob)   Clasificación por tipo de información proporcionadoc)    Clasificación por contextod)   Clasificaciones cruzadas Bradbury y Vehrencamp (2011)
1.7 La secuencia de los elementos de la comunicación animala)   Pasos involucrados en la comunicación Bradbury y Vehrencamp (2011)
2 Física, propagación y producción de las señales acústicas 10
2.1 Propiedades físicas del sonidoa)   Los medios de propagación de sonidob)   La naturaleza del sonidoc)    La caracterización de los sonidosd)   La propagación del sonido Bradbury y Vehrencamp (2011)
2.2 Formas de generar señales acústicasa)   La producción de vibracionesb)   Modificación y acoplamiento de las señales de sonidoc)    Equilibrio de la amplificación y la eficiencia Bradbury y Vehrencamp (2011)
2.3 Practica 1: Propiedades físicas del sonido
3 Ecología y evolución de las señales acústicas 12
3.1 Transmisión del sonido en ambiente naturalesa)   Atenuaciónb)   Degradaciónc)    Reververaciónd)   Espacio activo Catchpole CK, Slater PJB (2008); Slabbekoorn (2004)
3.2 Comunicación con degradacióna)   Degradación de la señal: ¿perjuicio o beneficio?b)   Evaluación de la distancia basado en señales acústicas Slabbekoorn (2004)
3.3 Características de los hábitats y su relación con el desempeño de las señales acústicas   (a)   Heterogeneidad del hábitat y capas acústicamente distintas   (b)   Comunicación a través de capas: elección de la posición para vocalizar   (c)    Condiciones ambientales Slabbekoorn (2004)
3.4 Competencia por el espacio acústico   (d)   El ruido de hábitats naturales   (e)   Comparación acústica entre bosques y ciudades   (f)    Interferencia acústica entre individuos del mismo grupo taxonómico   (g)   Comunicación en organismos coloniales   (h)   Estrategias para lidiar con altos niveles de ruido Slabbekoorn (2004) Francis et al. (2009)
3.5 Selección ambiental y evolución de las señales acústicas   (a)   Señales acústicas y comparación entre especies con diferentes   hábitats   (b)   Divergencia de señales acústicas dentro de especies Slabbekoorn (2004)
3.6 Limitantes para la producción de señales acústicas   (a)   Tamaño del cuerpo   (b)   Forma de aparatos vocales   (c)    Otros factores Podos (1997; 2001); Fletcher N (2007); Linhart y Fuchs (2015)
4 Ambientes ruidosos, ruido urbano y comunicación animal 8
4.1 Detección de señales, ruido y la evolución de la comunicacióna)   Teoría de detección de la señal como modelo general para comunicaciónb)   Convergencia entre señales y ruidoc)    Aplicación de la Teoría de Detección a la comunicación animald)   Detección vs. discriminacióne)   Evolución de los receptoresf)    Evolución de las señalesg)   Otras teorías Wiley (2013)
4.2 La comunicación animal en ambientes ruidososa)   Enmascaramiento por ruido de señales acústicas en insectosb)   Producción y percepción de señales acústicas por peces en ambientes ruidososc)    Producción y percepción de señales acústicas por anuros en ambientes ruidososd)   Producción y percepción de señales acústicas por aves en ambientes ruidosose)   Producción y percepción de señales acústicas por mamíferos marinos en ambientes ruidosos Brumm H (ed) (2013)
4.3 Practica 2: Técnicas de grabación de señales acústicas 1
5 Bioacústica y conservación 6
5.1 Niveles y problemas en conservación: especies y ecosistemas Gaunt y McCallum (2004)
5.2 Aplicación de la Bioacústica a la conservacióna)   Limites de especieb)   Aplicaciones : censo, monitoreo, especies indicadoras, control de poblaciones y recuperación de especies Gaunt y McCallum (2004)
5.3 Instrumentos y métodosa)   Grabaciónb)   Playbacksc)    Grabaciones remotasd)   Estrategias de muestreo Gaunt y McCallum (2004)
5.4 Practica 3: Técnicas de grabación de señales acústicas 2 Laiolo (2010)
6 Grabación de señales acústicas 6
6.1 Equipo: Tipos de micrófonos, parábolas y grabadoras digitales Gerhardt (1998)
6.2 Muestreo digital: frecuencia de muestreo y tamaño de la muestra Gerhardt (1998)
6.3 Amplitud, direccionalidad y niveles de ruido de fondo Gerhardt (1998)
6.4 Patrones de propagación de sonidos en ambientes naturales Gerhardt (1998)
6.5 Practica 4: Análisis de sonidos en laboratorio 1 Budney y Grotke (1997)
7 Análisis en laboratorio de sonidos de animales 6
7.1 Definición de términos técnicos Gerhardt (1998)
7.2 Principios de análisis temporales y espectrales de señales acústicas Gerhardt (1998)
7.3 Ejemplos de descripciones y análisis de señales acústicas Gerhardt (1998)
7.4 Representación digital del sonido Raven Pro 1.4 Manual versión 11
7.5 Introducción al análisis de espectros para biólogos Raven Pro 1.4 Manual versión 11
7.6 Practica 5: Análisis de sonidos en laboratorio 2

V Bibliografía

(Las citas tienen un link a los publicaciones, las cuales podrás descargar en cualquier momento)

Libros y Capítulos de Libros

  1. Bradbury JW, Vehrencamp SL (2011) Principles of Animal Communication, Segunda Edición. Sunderland, MA. Sinauer Associates
  2. Catchpole CK, Slater PJB (2008) Bids songs: Biological themes and variations. Cambridge University Press.
  3. Brumm H (ed) (2013) Part II Acoustic Signals. In Animal Communication and Noise (Vol. 2), pp. 33-273, Springer
  4. Fichtel C, Manser M (2010). Vocal communication in social groups. In Animal Behaviour: Evolution and Mechanisms (Kappeler P, ed), pp. 29-54, Springer
  5. Fletcher N (2007) Animal Bioacoustics. In Springer Handbook of Acoustics (Rossing TD, ed), pp. 473–491, Springer
  6. Gaunt SLL, McCallum DA (2004) Birdsong and conservation. In Nature’s Music (Marler P, Slabbekoorn HW, eds), pp. 343-362, Elsevier
  7. Gerhardt HC (1998) Animal acoustic communication: sound analysis and research methods. Animal acoustic communication: sound analysis and research methods (Hopp S, Owren M, Evans C, Eds), pp. 1-26, Springer
  8. Gill D, Brumm H (Eds.) (2014) Avian Urban Ecology, Behavioural and Physiological Adaptations. Oxford, United Kingdom: Oxford University Press.
  9. Marler P (2004) Science and birdsong: the good old days. In Nature’s Music (Marler P, Slabbekoorn HW, eds), pp. 1-39, Elsevier
  10. Raven Pro 1.4 User’s Manual 2010. Revision 11. The Cornell Lab of Ornithology – Bioacoustics Research Program. Disponible en http://www.birds.cornell.edu/brp/raven/Raven14UsersManual.pdf
  11. Slabbekoorn HW (2004) Singing in the wild: the ecology of birdsong. In Nature’s Music: The Science of Birdsong (Marler P, Slabbekoorn HW, eds), pp. 178-205, Elsevier
  12. Wiley RH (2013) Signal Detection, Noise, and the Evolution of Communication. In Animal Communication and Noise (Vol. 2) (Brumm H, ed) pp. 7-32, Springer

Artículos científicos y revisiones

  1. Budney GF, Grotke RW (1997) Techniques for audio recording vocalizations of tropical birds. Ornithological Monographs 48:147-163
  2. Couldridge VCK, Staaden MJV(2004). Habitat-dependent transmission of male advertisement calls in bladder grasshoppers (Orthoptera; Pneumoridae). The Journal of Experimental Biology 207:2777–2786
  3. Francis CD, Ortega CP, Cruz A (2009) Noise pollution changes avian communities and species interactions. Current Biology 19:1415–1419
  4. Laiolo P (2010) The emerging significance of bioacoustics in animal species conservation. Biological Conservation 143:1635–1645
  5. Linhart P, Fuchs R (2015) Song pitch indicates body size and correlates with males’ response to playback in a songbird. Animal Behaviour 103:91–98
  6. Podos J (1997) A performance constraint on the evolution of trilled vocalizations in a songbird family (Passeriformes: Emberizidae). Evolution 51:537–551
  7. Podos J (2001) Correlated evolution of morphology and vocal signal structure in Darwin’s finches. Nature 409:185–188
  8. Podos J, Huber SK, Taft B (2004) BIRD SONG: The Interface of Evolution and Mechanism. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 35:55–87
  9. Stanley  CQ, et al. (2016) Insect noise avoidance in the dawn chorus of Neotropical birds. Animal Behaviour 112:255-265

  10. Wilkins M, Seddon N, Safran R (2013) Evolutionary divergence in acoustic signals: causes and consequences. Trends in Ecology & Evolution 28:156–66

Material de apoyo

  1. Audio Equipment. Macaulay Library, The Cornell Lab of Ornithology. https://macaulaylibrary.org/documents/AudioEquipment.pdf
  2. Field Recording Equipment. Macaulay Library, The Cornell Lab of Ornithology. http://content.ornith.cornell.edu/UEWebApp/data/bin/RecordingEquipment.pdf
  3. Biblioteca de sonidos de las aves de México. www.ecologia.edu.mx/sonidos/

Software

  1. Raven: Una versión lite (gratuita) puede bajarse de la siguiente dirección: www.birds.cornell.edu/brp/raven/RavenVersions.html#RavenLite
  2. Syrinx: La versión completa gratuita se puede bajar de: www.syrinxpc.com

Bienvenido Fernando González

grabando sendero prusiaEl Laboratorio de Bioacústica y Ecología del Comportamiento le da la bienvenida a Fernando González García del INECOL, quien estará con nosotros realizando una estancia sabática. Fernando es experto en grabaciones de vocalizaciones de aves y se especializa en el estudio de la ecología y conservación del pavón (Oreophasis derbianus). Fernando es creador y responsable de la primera Biblioteca de Sonidos de las Aves de México y ha promovido el uso de la bioacústica mediante cursos en diversos estados de México y países de Centroamérica.

Bienvenido Fernando!

Visita la página del M. en C. Fernando González García

Curso: Seminario III

SEMINARIO III

En esta sección encontrarán las presentaciones ofrecidas durante el curso en versión PDF, así como actividades y materiales relacionados con el curso. (Para descargar la información deseada haz click en los enlaces resaltados en color)

  1. Clase #1
    • Presentación #1
  2. Clase #2 (20/Septiembre/2017)
  3. Clase #3 (4/Octubre/2017)